Los modelos, entonces, buscan ser una representación simple de un sistema, que nos permite imaginar lo que no podemos ver. Dado que la representación es lo más simple posible para poder concentrarnos en los aspectos del sistema que nos interesan, el modelo tiene limitaciones. Estas mismas limitaciones nos llevan a entender que los modelos no son ni ciertos ni falsos: son solamente más o menos adecuados para describir la situación que se analiza.

Otro de los aspectos importantes de los modelos teóricos es que cambian con el tiempo a fin de acomodar nuevos datos, o bien porque son reemplazados por versiones más elegantes o económicas, o incluso simplemente porque pasan de moda.

Al igual que los modelos, las teorías no son ciertas ni falsas sino más o menos válidas. Consideraremos válida a una teoría si de sus premisas básicas o postulados principales puede derivarse lógicamente el cúmulo de observaciones que la teoría busca explicar. Es decir, cuanto mayor es el conjunto de observaciones que adquiere sentido dentro de las ideas de la teoría, más creeremos en ella. Asimismo, cuanto más precisas sean las predicciones generadas por la teoría, mayor será nuestra confianza en ella.

Creemos que los modelos teóricos deben jugar un rol central en las clases de ciencia. Ponemos gran énfasis en los modelos porque, a diferencia de lo que ocurre con las grandes teorías, los alumnos pueden adquirir la experiencia directa de formularlos. Esta experiencia, argumentamos, les servirá de base para entender las teorías que deban aprender.

Idear un modelo es un acto creativo, que requiere imaginación y destreza. No es un arte que surge espontáneamente sino una herramienta que hay que aprender a usar. Una forma atractiva de entrenar a los alumnos en el uso de esta herramienta es desarrollar un currículo para un tema acotado, en el que los alumnos elaboren un modelo desde sus cimientos, mediante el uso de indagación guiada.

Parte del trabajo en el aula, deberá estar focalizado en estudiar la naturaleza de las ideas que se introducen: cómo ayudan a entender lo que se estudia y cómo difieren de aquello que se observa directamente.

Otra parte importante del trabajo en el aula deberá emular o enfatizar la doble función del científico: la creación de ideas y la argumentación crítica.